Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxe3Q9QY14 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms