Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb1Q9QXJ1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms