Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Limd1Q9QXD8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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