Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms