Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyth1Q9QX11 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyth1Q9QX11 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms