Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rai2Q9QVY8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rai2Q9QVY8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms