Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cul3Q9JLV5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms