Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk3aQ9JKX8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms