Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms