Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms