Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ropn1Q9ESG2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms