Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ush1cQ9ES64 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ush1cQ9ES64 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms