Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr61Q9ERF3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr61Q9ERF3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms