Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms