Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx6Q9DBY5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx6Q9DBY5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms