Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tysnd1Q9DBA6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms