Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms