Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn9Q9D805 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms