Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp5Q9D7S9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp5Q9D7S9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms