Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H5

Zdhhc4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc4Q9D6H5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zdhhc4Q9D6H5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms