Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra4Q9D6F4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms