Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PudpQ9D5U5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms