Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc130Q9D516 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms