Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Odf2lQ9D478 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2lQ9D478 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms