Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spns3Q9D232 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Spns3Q9D232 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Spns3Q9D232 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Spns3Q9D232 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spns3Q9D232 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms