Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ss18l2Q9D174 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18l2Q9D174 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18l2Q9D174 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18l2Q9D174 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18l2Q9D174 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18l2Q9D174 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18l2Q9D174 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ss18l2Q9D174 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18l2Q9D174 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ss18l2Q9D174 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ss18l2Q9D174 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ss18l2Q9D174 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ss18l2Q9D174 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ss18l2Q9D174 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ss18l2Q9D174 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ss18l2Q9D174 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ss18l2Q9D174 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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