Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T7

Gkn3, Gastrokine-3, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn3Q9D0T7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn3Q9D0T7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms