Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms