Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms