Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnot11Q9CWN7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms