Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Pfdn1Q9CWM4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Pfdn1Q9CWM4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn1Q9CWM4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pfdn1Q9CWM4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pfdn1Q9CWM4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pfdn1Q9CWM4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pfdn1Q9CWM4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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