Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma8Q9CWH6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma8Q9CWH6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms