Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms