Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp13a2Q9CTG6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms