Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd1Q9CRY7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd1Q9CRY7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd1Q9CRY7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd1Q9CRY7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gdpd1Q9CRY7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gdpd1Q9CRY7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdpd1Q9CRY7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gdpd1Q9CRY7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms