Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PclafQ9CQX4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms