Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms