Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmed6Q9CQG0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmed6Q9CQG0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmed6Q9CQG0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmed6Q9CQG0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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