Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Atp6v0e1Q9CQD8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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