Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms