Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Trim12aQ99PQ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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