Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl43Q99N89 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl43Q99N89 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms