Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pink1Q99MQ3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms