Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b4Q99ME6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1b4Q99ME6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms