Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca3Q99M54 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdca3Q99M54 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms