Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gins4Q99LZ3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gins4Q99LZ3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms