Protein–RNA interactions for Protein: Q99L88

Sntb1, Beta-1-syntrophin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntb1Q99L88 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sntb1Q99L88 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sntb1Q99L88 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sntb1Q99L88 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms