Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q99KU6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q99KU6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q99KU6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q99KU6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q99KU6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q99KU6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms