Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab28Q99KL7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms