Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms